В начале 2017 года Михаил Полунин возглавил временную администрацию «Агентства по страхованию вкладов» в санируемом банке «Пересвет», занимаясь реализацией программы по предотвращению банкротства банка. Затем Полунин занял пост президента АКБ «Пересвет», исполняя, в том числе, функции председателя правления банка. В ноябре 2017 года Михаил Полунин, имеющий огромный опыт работы со стратегическими клиентами и проблемными активами, был приглашен для выполнения этих функций в «Московский кредитный банк», заняв должность советника председателя правления. Меньше чем через год, по согласованию с Центробанком РФ, Михаил Полунин занял пост первого заместителя председателя правления МКБ.